Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN3Q58A45 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN3Q58A45 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN3Q58A45 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAN3Q58A45 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAN3Q58A45 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAN3Q58A45 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAN3Q58A45 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAN3Q58A45 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAN3Q58A45 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAN3Q58A45 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAN3Q58A45 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAN3Q58A45 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAN3Q58A45 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAN3Q58A45 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAN3Q58A45 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAN3Q58A45 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAN3Q58A45 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAN3Q58A45 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAN3Q58A45 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAN3Q58A45 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAN3Q58A45 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAN3Q58A45 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAN3Q58A45 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAN3Q58A45 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms