Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTLL9Q3SXZ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTLL9Q3SXZ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTLL9Q3SXZ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTLL9Q3SXZ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTLL9Q3SXZ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL9Q3SXZ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTLL9Q3SXZ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL9Q3SXZ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL9Q3SXZ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL9Q3SXZ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTLL9Q3SXZ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL9Q3SXZ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL9Q3SXZ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL9Q3SXZ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTLL9Q3SXZ7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms