Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF3Q3KNV8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF3Q3KNV8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF3Q3KNV8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF3Q3KNV8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF3Q3KNV8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF3Q3KNV8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF3Q3KNV8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF3Q3KNV8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF3Q3KNV8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF3Q3KNV8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF3Q3KNV8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF3Q3KNV8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF3Q3KNV8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF3Q3KNV8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF3Q3KNV8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF3Q3KNV8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF3Q3KNV8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF3Q3KNV8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF3Q3KNV8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF3Q3KNV8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF3Q3KNV8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF3Q3KNV8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF3Q3KNV8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF3Q3KNV8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF3Q3KNV8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF3Q3KNV8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF3Q3KNV8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF3Q3KNV8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF3Q3KNV8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF3Q3KNV8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF3Q3KNV8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF3Q3KNV8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms