Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V0

MS4A18, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 18, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A18Q3C1V0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A18Q3C1V0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A18Q3C1V0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A18Q3C1V0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A18Q3C1V0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A18Q3C1V0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A18Q3C1V0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A18Q3C1V0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A18Q3C1V0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A18Q3C1V0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A18Q3C1V0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A18Q3C1V0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A18Q3C1V0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A18Q3C1V0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A18Q3C1V0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A18Q3C1V0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A18Q3C1V0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A18Q3C1V0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A18Q3C1V0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A18Q3C1V0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A18Q3C1V0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A18Q3C1V0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A18Q3C1V0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 565.7 ms