Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM16LQ309B1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM16LQ309B1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM16LQ309B1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM16LQ309B1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM16LQ309B1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM16LQ309B1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM16LQ309B1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM16LQ309B1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM16LQ309B1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM16LQ309B1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM16LQ309B1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM16LQ309B1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM16LQ309B1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM16LQ309B1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM16LQ309B1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM16LQ309B1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM16LQ309B1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRIM16LQ309B1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM16LQ309B1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM16LQ309B1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM16LQ309B1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM16LQ309B1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM16LQ309B1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM16LQ309B1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM16LQ309B1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM16LQ309B1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM16LQ309B1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM16LQ309B1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM16LQ309B1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM16LQ309B1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms