Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DRB5Q30154 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DRB5Q30154 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DRB5Q30154 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DRB5Q30154 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms