Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB90

HKDC1, Putative hexokinase HKDC1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKDC1Q2TB90 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HKDC1Q2TB90 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HKDC1Q2TB90 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HKDC1Q2TB90 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HKDC1Q2TB90 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HKDC1Q2TB90 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HKDC1Q2TB90 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HKDC1Q2TB90 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HKDC1Q2TB90 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HKDC1Q2TB90 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HKDC1Q2TB90 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HKDC1Q2TB90 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HKDC1Q2TB90 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HKDC1Q2TB90 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HKDC1Q2TB90 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HKDC1Q2TB90 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HKDC1Q2TB90 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms