Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CACNA1EQ15878 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNA1EQ15878 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1EQ15878 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1EQ15878 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1EQ15878 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1EQ15878 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1EQ15878 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1EQ15878 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1EQ15878 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1EQ15878 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1EQ15878 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1EQ15878 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1EQ15878 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA1EQ15878 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA1EQ15878 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1EQ15878 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1EQ15878 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1EQ15878 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1EQ15878 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1EQ15878 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1EQ15878 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA1EQ15878 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA1EQ15878 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1EQ15878 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1EQ15878 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1EQ15878 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1EQ15878 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1EQ15878 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms