Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1DQ13901 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C1DQ13901 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1DQ13901 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1DQ13901 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1DQ13901 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1DQ13901 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1DQ13901 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1DQ13901 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1DQ13901 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1DQ13901 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1DQ13901 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1DQ13901 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1DQ13901 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1DQ13901 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1DQ13901 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1DQ13901 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1DQ13901 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1DQ13901 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1DQ13901 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1DQ13901 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1DQ13901 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C1DQ13901 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1DQ13901 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1DQ13901 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1DQ13901 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1DQ13901 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1DQ13901 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1DQ13901 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1DQ13901 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1DQ13901 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1DQ13901 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1DQ13901 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1DQ13901 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1DQ13901 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1DQ13901 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1DQ13901 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1DQ13901 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1DQ13901 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1DQ13901 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1DQ13901 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1DQ13901 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1DQ13901 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1DQ13901 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1DQ13901 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1DQ13901 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1DQ13901 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1DQ13901 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1DQ13901 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1DQ13901 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1DQ13901 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1DQ13901 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1DQ13901 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1DQ13901 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C1DQ13901 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C1DQ13901 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1DQ13901 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1DQ13901 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1DQ13901 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1DQ13901 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1DQ13901 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1DQ13901 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1DQ13901 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1DQ13901 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1DQ13901 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1DQ13901 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1DQ13901 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1DQ13901 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C1DQ13901 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1DQ13901 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1DQ13901 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1DQ13901 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1DQ13901 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1DQ13901 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1DQ13901 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1DQ13901 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1DQ13901 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1DQ13901 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1DQ13901 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1DQ13901 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1DQ13901 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1DQ13901 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1DQ13901 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1DQ13901 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1DQ13901 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1DQ13901 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1DQ13901 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1DQ13901 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1DQ13901 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1DQ13901 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1DQ13901 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1DQ13901 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1DQ13901 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C1DQ13901 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1DQ13901 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1DQ13901 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1DQ13901 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1DQ13901 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1DQ13901 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1DQ13901 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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