Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA9Q13797 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA9Q13797 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA9Q13797 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA9Q13797 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA9Q13797 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA9Q13797 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA9Q13797 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA9Q13797 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA9Q13797 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA9Q13797 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA9Q13797 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA9Q13797 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA9Q13797 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA9Q13797 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA9Q13797 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA9Q13797 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA9Q13797 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA9Q13797 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA9Q13797 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGA9Q13797 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA9Q13797 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA9Q13797 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA9Q13797 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA9Q13797 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA9Q13797 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA9Q13797 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA9Q13797 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA9Q13797 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA9Q13797 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA9Q13797 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA9Q13797 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA9Q13797 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA9Q13797 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA9Q13797 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA9Q13797 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA9Q13797 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA9Q13797 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA9Q13797 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA9Q13797 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA9Q13797 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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