Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CACNA1SQ13698 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CACNA1SQ13698 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CACNA1SQ13698 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CACNA1SQ13698 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CACNA1SQ13698 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CACNA1SQ13698 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CACNA1SQ13698 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CACNA1SQ13698 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CACNA1SQ13698 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CACNA1SQ13698 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CACNA1SQ13698 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CACNA1SQ13698 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CACNA1SQ13698 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CACNA1SQ13698 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CACNA1SQ13698 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CACNA1SQ13698 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CACNA1SQ13698 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CACNA1SQ13698 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CACNA1SQ13698 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CACNA1SQ13698 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CACNA1SQ13698 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CACNA1SQ13698 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CACNA1SQ13698 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CACNA1SQ13698 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CACNA1SQ13698 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CACNA1SQ13698 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CACNA1SQ13698 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CACNA1SQ13698 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CACNA1SQ13698 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CACNA1SQ13698 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CACNA1SQ13698 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CACNA1SQ13698 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CACNA1SQ13698 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CACNA1SQ13698 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CACNA1SQ13698 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CACNA1SQ13698 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CACNA1SQ13698 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CACNA1SQ13698 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CACNA1SQ13698 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CACNA1SQ13698 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CACNA1SQ13698 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CACNA1SQ13698 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CACNA1SQ13698 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CACNA1SQ13698 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CACNA1SQ13698 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CACNA1SQ13698 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CACNA1SQ13698 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CACNA1SQ13698 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CACNA1SQ13698 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CACNA1SQ13698 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CACNA1SQ13698 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CACNA1SQ13698 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CACNA1SQ13698 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CACNA1SQ13698 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CACNA1SQ13698 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CACNA1SQ13698 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CACNA1SQ13698 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CACNA1SQ13698 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CACNA1SQ13698 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CACNA1SQ13698 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CACNA1SQ13698 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CACNA1SQ13698 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CACNA1SQ13698 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CACNA1SQ13698 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CACNA1SQ13698 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CACNA1SQ13698 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CACNA1SQ13698 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
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