Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MTM1Q13496 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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