Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTM1Q13496 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTM1Q13496 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTM1Q13496 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTM1Q13496 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTM1Q13496 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTM1Q13496 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MTM1Q13496 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms