Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS2P3Q13401 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS2P3Q13401 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS2P3Q13401 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS2P3Q13401 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS2P3Q13401 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS2P3Q13401 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS2P3Q13401 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS2P3Q13401 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS2P3Q13401 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS2P3Q13401 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS2P3Q13401 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS2P3Q13401 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS2P3Q13401 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMS2P3Q13401 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMS2P3Q13401 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMS2P3Q13401 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMS2P3Q13401 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMS2P3Q13401 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMS2P3Q13401 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS2P3Q13401 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS2P3Q13401 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PMS2P3Q13401 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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