Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NR1H3Q13133 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NR1H3Q13133 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR1H3Q13133 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR1H3Q13133 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR1H3Q13133 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR1H3Q13133 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR1H3Q13133 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR1H3Q13133 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NR1H3Q13133 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NR1H3Q13133 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NR1H3Q13133 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NR1H3Q13133 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NR1H3Q13133 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR1H3Q13133 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR1H3Q13133 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR1H3Q13133 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR1H3Q13133 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR1H3Q13133 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR1H3Q13133 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR1H3Q13133 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR1H3Q13133 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR1H3Q13133 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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NR1H3Q13133 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
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NR1H3Q13133 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NR1H3Q13133 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NR1H3Q13133 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NR1H3Q13133 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NR1H3Q13133 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NR1H3Q13133 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NR1H3Q13133 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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NR1H3Q13133 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NR1H3Q13133 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NR1H3Q13133 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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NR1H3Q13133 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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NR1H3Q13133 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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NR1H3Q13133 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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NR1H3Q13133 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NR1H3Q13133 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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NR1H3Q13133 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NR1H3Q13133 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NR1H3Q13133 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
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