Protein–RNA interactions for Protein: Q12100

RTK1, Probable serine/threonine-protein kinase RTK1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTK1Q12100 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.96□□□□□ -0.98
RTK1Q12100 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.96□□□□□ -0.98
RTK1Q12100 UTR1YJR049C 1593 nt8.95□□□□□ -0.98
RTK1Q12100 SED1YDR077W 1017 nt8.93□□□□□ -0.98
RTK1Q12100 YJR154WYJR154W 1041 nt8.93□□□□□ -0.98
RTK1Q12100 MET8YBR213W 825 nt8.93□□□□□ -0.98
RTK1Q12100 UGA4YDL210W 1716 nt8.93□□□□□ -0.98
RTK1Q12100 PAR32YDL173W 888 nt8.92□□□□□ -0.98
RTK1Q12100 SAM35YHR083W 990 nt8.91□□□□□ -0.98
RTK1Q12100 YJL055WYJL055W 738 nt8.91□□□□□ -0.98
RTK1Q12100 YIA6YIL006W 1122 nt8.9□□□□□ -0.98
RTK1Q12100 BSP1YPR171W 1731 nt8.9□□□□□ -0.98
RTK1Q12100 SFP1YLR403W 2052 nt8.9□□□□□ -0.99
RTK1Q12100 THI72YOR192C 1800 nt8.89□□□□□ -0.99
RTK1Q12100 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.89□□□□□ -0.99
RTK1Q12100 ERG6YML008C 1152 nt8.87□□□□□ -0.99
RTK1Q12100 SSN3YPL042C 1668 nt8.87□□□□□ -0.99
RTK1Q12100 YAT1YAR035W 2064 nt8.86□□□□□ -0.99
RTK1Q12100 MET2YNL277W 1461 nt8.86□□□□□ -0.99
RTK1Q12100 SOD2YHR008C 702 nt8.85□□□□□ -0.99
RTK1Q12100 TIP1YBR067C 633 nt8.85□□□□□ -0.99
RTK1Q12100 NPP1YCR026C 2229 nt8.85□□□□□ -0.99
RTK1Q12100 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.83□□□□□ -1
RTK1Q12100 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.83□□□□□ -1
RTK1Q12100 GSF2YML048W 1212 nt8.83□□□□□ -1
RTK1Q12100 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.83□□□□□ -1
RTK1Q12100 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.83□□□□□ -1
RTK1Q12100 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.83□□□□□ -1
RTK1Q12100 CSM1YCR086W 573 nt8.82□□□□□ -1
RTK1Q12100 YMR262WYMR262W 942 nt8.82□□□□□ -1
RTK1Q12100 LIP1YMR298W 453 nt8.82□□□□□ -1
RTK1Q12100 RIB7YBR153W 735 nt8.82□□□□□ -1
RTK1Q12100 LSB5YCL034W 1065 nt8.82□□□□□ -1
RTK1Q12100 GAL3YDR009W 1563 nt8.81□□□□□ -1
RTK1Q12100 YJL118WYJL118W 660 nt8.8□□□□□ -1
RTK1Q12100 GID7YCL039W 2238 nt8.79□□□□□ -1
RTK1Q12100 MHF1YOL086W-A 273 nt8.79□□□□□ -1
RTK1Q12100 PRM5YIL117C 957 nt8.78□□□□□ -1
RTK1Q12100 QDR2YIL121W 1629 nt8.77□□□□□ -1.01
RTK1Q12100 POT1YIL160C 1254 nt8.77□□□□□ -1.01
RTK1Q12100 YPL251WYPL251W 303 nt8.77□□□□□ -1.01
RTK1Q12100 TUB4YLR212C 1422 nt8.77□□□□□ -1.01
RTK1Q12100 HIF1YLL022C 1158 nt8.76□□□□□ -1.01
RTK1Q12100 POP2YNR052C 1302 nt8.76□□□□□ -1.01
RTK1Q12100 RPT5YOR117W 1305 nt8.76□□□□□ -1.01
RTK1Q12100 YCP4YCR004C 744 nt8.75□□□□□ -1.01
RTK1Q12100 MEP3YPR138C 1470 nt8.75□□□□□ -1.01
RTK1Q12100 NUC1YJL208C 990 nt8.74□□□□□ -1.01
RTK1Q12100 LEU9YOR108W 1815 nt8.73□□□□□ -1.01
RTK1Q12100 SNZ1YMR096W 894 nt8.72□□□□□ -1.01
RTK1Q12100 PHO23YNL097C 993 nt8.72□□□□□ -1.01
RTK1Q12100 DBP1YPL119C 1854 nt8.72□□□□□ -1.01
RTK1Q12100 BRR1YPR057W 1026 nt8.71□□□□□ -1.02
RTK1Q12100 YPR126CYPR126C 309 nt8.71□□□□□ -1.02
RTK1Q12100 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.7□□□□□ -1.02
RTK1Q12100 YMR103CYMR103C 363 nt8.7□□□□□ -1.02
RTK1Q12100 YBL086CYBL086C 1401 nt8.7□□□□□ -1.02
RTK1Q12100 SAM3YPL274W 1764 nt8.69□□□□□ -1.02
RTK1Q12100 HXT1YHR094C 1713 nt8.67□□□□□ -1.02
RTK1Q12100 RSC4YKR008W 1878 nt8.67□□□□□ -1.02
RTK1Q12100 TOA2YKL058W 369 nt8.66□□□□□ -1.02
RTK1Q12100 IML3YBR107C 738 nt8.66□□□□□ -1.02
RTK1Q12100 CTI6YPL181W 1521 nt8.65□□□□□ -1.02
RTK1Q12100 APS2YJR058C 444 nt8.65□□□□□ -1.02
RTK1Q12100 MSC1YML128C 1542 nt8.64□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 DAK2YFL053W 1776 nt8.64□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 BNI5YNL166C 1347 nt8.63□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 NIF3YGL221C 867 nt8.63□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.63□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 SAM50YNL026W 1455 nt8.63□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 MAS1YLR163C 1389 nt8.62□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 OXA1YER154W 1209 nt8.62□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 RPC82YPR190C 1965 nt8.61□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 IGD1YFR017C 588 nt8.61□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 HMG2YLR450W 3138 nt8.61□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 MAE1YKL029C 2010 nt8.6□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 YNL024CYNL024C 741 nt8.6□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 TPO4YOR273C 1980 nt8.6□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 SEC61YLR378C 1443 nt8.6□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 MCM5YLR274W 2328 nt8.59□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 SPT20YOL148C 1815 nt8.59□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 OYE2YHR179W 1203 nt8.59□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 BUD20YLR074C 501 nt8.59□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 KRE1YNL322C 942 nt8.59□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 INA1YLR413W 2028 nt8.59□□□□□ -1.03
RTK1Q12100 TPS1YBR126C 1488 nt8.57□□□□□ -1.04
RTK1Q12100 PAB1YER165W 1734 nt8.57□□□□□ -1.04
RTK1Q12100 GND2YGR256W 1479 nt8.57□□□□□ -1.04
RTK1Q12100 ZRT3YKL175W 1512 nt8.56□□□□□ -1.04
RTK1Q12100 ESBP6YNL125C 2022 nt8.55□□□□□ -1.04
RTK1Q12100 YCR025CYCR025C 411 nt8.55□□□□□ -1.04
RTK1Q12100 SWM1YDR260C 513 nt8.54□□□□□ -1.04
RTK1Q12100 SAM2YDR502C 1155 nt8.54□□□□□ -1.04
RTK1Q12100 IPL1YPL209C 1104 nt8.54□□□□□ -1.04
RTK1Q12100 UFO1YML088W 2007 nt8.54□□□□□ -1.04
RTK1Q12100 RIM8YGL045W 1629 nt8.53□□□□□ -1.04
RTK1Q12100 YER188WYER188W 720 nt8.52□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 RAS2YNL098C 969 nt8.52□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 EAF3YPR023C 1206 nt8.52□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 ACO2YJL200C 2370 nt8.51□□□□□ -1.05
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