Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE4CQ08493 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE4CQ08493 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4CQ08493 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4CQ08493 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4CQ08493 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4CQ08493 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4CQ08493 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4CQ08493 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4CQ08493 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4CQ08493 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4CQ08493 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4CQ08493 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE4CQ08493 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE4CQ08493 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE4CQ08493 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4CQ08493 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4CQ08493 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4CQ08493 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4CQ08493 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4CQ08493 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4CQ08493 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE4CQ08493 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4CQ08493 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4CQ08493 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4CQ08493 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4CQ08493 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4CQ08493 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4CQ08493 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4CQ08493 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4CQ08493 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4CQ08493 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4CQ08493 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4CQ08493 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4CQ08493 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4CQ08493 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4CQ08493 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4CQ08493 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4CQ08493 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4CQ08493 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4CQ08493 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4CQ08493 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4CQ08493 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4CQ08493 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4CQ08493 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4CQ08493 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4CQ08493 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms