Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCDQ05655 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCDQ05655 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCDQ05655 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCDQ05655 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCDQ05655 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCDQ05655 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCDQ05655 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCDQ05655 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCDQ05655 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCDQ05655 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCDQ05655 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCDQ05655 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCDQ05655 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCDQ05655 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCDQ05655 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKCDQ05655 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCDQ05655 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCDQ05655 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCDQ05655 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCDQ05655 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCDQ05655 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCDQ05655 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCDQ05655 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCDQ05655 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCDQ05655 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCDQ05655 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCDQ05655 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCDQ05655 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCDQ05655 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCDQ05655 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCDQ05655 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms