Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSBP1Q04837 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSBP1Q04837 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSBP1Q04837 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSBP1Q04837 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSBP1Q04837 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSBP1Q04837 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSBP1Q04837 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms