Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPCQ03188 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPCQ03188 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPCQ03188 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPCQ03188 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPCQ03188 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPCQ03188 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPCQ03188 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPCQ03188 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPCQ03188 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPCQ03188 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPCQ03188 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPCQ03188 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPCQ03188 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPCQ03188 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CENPCQ03188 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPCQ03188 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPCQ03188 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPCQ03188 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPCQ03188 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPCQ03188 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPCQ03188 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPCQ03188 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPCQ03188 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPCQ03188 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPCQ03188 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPCQ03188 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPCQ03188 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CENPCQ03188 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms