Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CRB1P82279 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CRB1P82279 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CRB1P82279 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CRB1P82279 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CRB1P82279 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CRB1P82279 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CRB1P82279 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CRB1P82279 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CRB1P82279 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CRB1P82279 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CRB1P82279 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CRB1P82279 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CRB1P82279 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CRB1P82279 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CRB1P82279 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CRB1P82279 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CRB1P82279 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CRB1P82279 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CRB1P82279 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CRB1P82279 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CRB1P82279 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CRB1P82279 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CRB1P82279 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CRB1P82279 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CRB1P82279 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CRB1P82279 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CRB1P82279 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CRB1P82279 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CRB1P82279 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CRB1P82279 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CRB1P82279 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CRB1P82279 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CRB1P82279 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CRB1P82279 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CRB1P82279 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CRB1P82279 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CRB1P82279 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CRB1P82279 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CRB1P82279 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CRB1P82279 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CRB1P82279 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CRB1P82279 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CRB1P82279 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CRB1P82279 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CRB1P82279 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CRB1P82279 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CRB1P82279 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CRB1P82279 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CRB1P82279 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CRB1P82279 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CRB1P82279 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CRB1P82279 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CRB1P82279 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CRB1P82279 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CRB1P82279 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CRB1P82279 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CRB1P82279 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CRB1P82279 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CRB1P82279 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CRB1P82279 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CRB1P82279 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CRB1P82279 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CRB1P82279 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CRB1P82279 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CRB1P82279 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CRB1P82279 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CRB1P82279 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CRB1P82279 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
CRB1P82279 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CRB1P82279 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CRB1P82279 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CRB1P82279 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CRB1P82279 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CRB1P82279 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CRB1P82279 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CRB1P82279 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CRB1P82279 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CRB1P82279 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CRB1P82279 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CRB1P82279 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CRB1P82279 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CRB1P82279 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CRB1P82279 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CRB1P82279 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CRB1P82279 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CRB1P82279 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CRB1P82279 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CRB1P82279 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CRB1P82279 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CRB1P82279 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CRB1P82279 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CRB1P82279 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CRB1P82279 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CRB1P82279 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CRB1P82279 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CRB1P82279 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CRB1P82279 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CRB1P82279 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CRB1P82279 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms