Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPC5P78333 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GPC5P78333 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPC5P78333 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPC5P78333 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPC5P78333 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPC5P78333 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPC5P78333 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPC5P78333 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPC5P78333 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPC5P78333 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GPC5P78333 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPC5P78333 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC5P78333 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC5P78333 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC5P78333 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPC5P78333 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPC5P78333 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GPC5P78333 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPC5P78333 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GPC5P78333 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPC5P78333 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPC5P78333 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPC5P78333 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPC5P78333 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPC5P78333 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPC5P78333 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPC5P78333 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPC5P78333 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPC5P78333 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPC5P78333 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPC5P78333 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPC5P78333 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPC5P78333 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPC5P78333 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GPC5P78333 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GPC5P78333 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPC5P78333 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPC5P78333 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPC5P78333 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPC5P78333 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPC5P78333 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPC5P78333 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPC5P78333 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPC5P78333 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPC5P78333 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GPC5P78333 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPC5P78333 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPC5P78333 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPC5P78333 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPC5P78333 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPC5P78333 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPC5P78333 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPC5P78333 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPC5P78333 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPC5P78333 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPC5P78333 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPC5P78333 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPC5P78333 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPC5P78333 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPC5P78333 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPC5P78333 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPC5P78333 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPC5P78333 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPC5P78333 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GPC5P78333 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPC5P78333 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPC5P78333 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPC5P78333 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPC5P78333 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPC5P78333 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPC5P78333 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPC5P78333 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPC5P78333 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPC5P78333 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPC5P78333 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC5P78333 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC5P78333 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPC5P78333 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GPC5P78333 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GPC5P78333 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPC5P78333 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPC5P78333 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPC5P78333 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPC5P78333 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPC5P78333 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPC5P78333 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC5P78333 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC5P78333 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC5P78333 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC5P78333 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC5P78333 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC5P78333 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC5P78333 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC5P78333 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC5P78333 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC5P78333 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPC5P78333 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPC5P78333 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GPC5P78333 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms