Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP4F2P78329 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP4F2P78329 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP4F2P78329 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP4F2P78329 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP4F2P78329 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP4F2P78329 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP4F2P78329 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP4F2P78329 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP4F2P78329 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP4F2P78329 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP4F2P78329 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP4F2P78329 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP4F2P78329 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP4F2P78329 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP4F2P78329 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP4F2P78329 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP4F2P78329 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP4F2P78329 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP4F2P78329 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP4F2P78329 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP4F2P78329 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP4F2P78329 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP4F2P78329 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP4F2P78329 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP4F2P78329 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP4F2P78329 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP4F2P78329 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP4F2P78329 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F2P78329 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F2P78329 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F2P78329 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4F2P78329 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4F2P78329 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4F2P78329 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4F2P78329 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4F2P78329 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4F2P78329 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F2P78329 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F2P78329 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F2P78329 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms