Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM193AP78312 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM193AP78312 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FAM193AP78312 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM193AP78312 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM193AP78312 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM193AP78312 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM193AP78312 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM193AP78312 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM193AP78312 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM193AP78312 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM193AP78312 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM193AP78312 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM193AP78312 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM193AP78312 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM193AP78312 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM193AP78312 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM193AP78312 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM193AP78312 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM193AP78312 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FAM193AP78312 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM193AP78312 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM193AP78312 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM193AP78312 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM193AP78312 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM193AP78312 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM193AP78312 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM193AP78312 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM193AP78312 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM193AP78312 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM193AP78312 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms