Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCS1P62166 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCS1P62166 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCS1P62166 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCS1P62166 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCS1P62166 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCS1P62166 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCS1P62166 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCS1P62166 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCS1P62166 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCS1P62166 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCS1P62166 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCS1P62166 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCS1P62166 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCS1P62166 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCS1P62166 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCS1P62166 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCS1P62166 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCS1P62166 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCS1P62166 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCS1P62166 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCS1P62166 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCS1P62166 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCS1P62166 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCS1P62166 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NCS1P62166 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCS1P62166 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCS1P62166 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCS1P62166 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCS1P62166 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCS1P62166 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCS1P62166 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCS1P62166 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCS1P62166 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCS1P62166 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCS1P62166 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCS1P62166 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCS1P62166 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCS1P62166 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCS1P62166 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCS1P62166 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCS1P62166 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCS1P62166 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCS1P62166 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCS1P62166 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCS1P62166 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCS1P62166 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCS1P62166 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCS1P62166 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCS1P62166 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCS1P62166 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCS1P62166 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCS1P62166 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCS1P62166 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCS1P62166 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCS1P62166 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCS1P62166 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NCS1P62166 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCS1P62166 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCS1P62166 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCS1P62166 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCS1P62166 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCS1P62166 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCS1P62166 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCS1P62166 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCS1P62166 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCS1P62166 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCS1P62166 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCS1P62166 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCS1P62166 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCS1P62166 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCS1P62166 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCS1P62166 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCS1P62166 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCS1P62166 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCS1P62166 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCS1P62166 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCS1P62166 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCS1P62166 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCS1P62166 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCS1P62166 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCS1P62166 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCS1P62166 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCS1P62166 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCS1P62166 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCS1P62166 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCS1P62166 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCS1P62166 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCS1P62166 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCS1P62166 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCS1P62166 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NCS1P62166 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCS1P62166 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCS1P62166 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCS1P62166 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCS1P62166 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCS1P62166 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCS1P62166 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCS1P62166 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCS1P62166 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms