Protein–RNA interactions for Protein: P61619

SEC61A1, Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC61A1P61619 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC61A1P61619 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC61A1P61619 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC61A1P61619 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC61A1P61619 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC61A1P61619 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC61A1P61619 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC61A1P61619 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC61A1P61619 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC61A1P61619 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC61A1P61619 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC61A1P61619 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC61A1P61619 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC61A1P61619 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC61A1P61619 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC61A1P61619 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC61A1P61619 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC61A1P61619 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC61A1P61619 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC61A1P61619 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC61A1P61619 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC61A1P61619 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC61A1P61619 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC61A1P61619 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC61A1P61619 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC61A1P61619 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC61A1P61619 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC61A1P61619 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC61A1P61619 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC61A1P61619 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC61A1P61619 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms