Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN17P56750 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN17P56750 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN17P56750 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN17P56750 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN17P56750 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms