Protein–RNA interactions for Protein: P56747

CLDN6, Claudin-6, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN6P56747 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN6P56747 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN6P56747 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN6P56747 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN6P56747 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN6P56747 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN6P56747 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN6P56747 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN6P56747 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN6P56747 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN6P56747 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN6P56747 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN6P56747 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN6P56747 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN6P56747 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN6P56747 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN6P56747 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN6P56747 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN6P56747 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN6P56747 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN6P56747 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN6P56747 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN6P56747 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN6P56747 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN6P56747 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN6P56747 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN6P56747 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN6P56747 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN6P56747 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN6P56747 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN6P56747 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN6P56747 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN6P56747 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN6P56747 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN6P56747 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN6P56747 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN6P56747 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN6P56747 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN6P56747 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN6P56747 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN6P56747 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN6P56747 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN6P56747 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN6P56747 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN6P56747 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN6P56747 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN6P56747 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms