Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTBP2P56545 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTBP2P56545 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP2P56545 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTBP2P56545 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTBP2P56545 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTBP2P56545 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTBP2P56545 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTBP2P56545 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTBP2P56545 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTBP2P56545 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTBP2P56545 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTBP2P56545 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTBP2P56545 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTBP2P56545 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms