Protein–RNA interactions for Protein: P56134

ATP5J2, ATP synthase subunit f, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5J2P56134 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP5J2P56134 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5J2P56134 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5J2P56134 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5J2P56134 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5J2P56134 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5J2P56134 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5J2P56134 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5J2P56134 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5J2P56134 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5J2P56134 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5J2P56134 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5J2P56134 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5J2P56134 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5J2P56134 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP5J2P56134 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms