Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH11P55287 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH11P55287 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH11P55287 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH11P55287 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH11P55287 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH11P55287 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH11P55287 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH11P55287 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH11P55287 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH11P55287 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH11P55287 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH11P55287 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH11P55287 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH11P55287 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH11P55287 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH11P55287 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH11P55287 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH11P55287 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH11P55287 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH11P55287 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH11P55287 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH11P55287 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH11P55287 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH11P55287 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH11P55287 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH11P55287 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH11P55287 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH11P55287 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH11P55287 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH11P55287 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH11P55287 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH11P55287 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH11P55287 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH11P55287 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH11P55287 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH11P55287 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH11P55287 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH11P55287 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH11P55287 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH11P55287 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH11P55287 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH11P55287 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH11P55287 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH11P55287 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH11P55287 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH11P55287 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH11P55287 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH11P55287 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH11P55287 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH11P55287 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH11P55287 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH11P55287 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH11P55287 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH11P55287 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH11P55287 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH11P55287 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH11P55287 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH11P55287 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH11P55287 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH11P55287 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH11P55287 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH11P55287 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH11P55287 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH11P55287 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH11P55287 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH11P55287 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH11P55287 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH11P55287 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH11P55287 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH11P55287 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH11P55287 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH11P55287 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH11P55287 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH11P55287 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH11P55287 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH11P55287 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH11P55287 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH11P55287 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH11P55287 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH11P55287 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH11P55287 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH11P55287 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH11P55287 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH11P55287 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH11P55287 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH11P55287 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH11P55287 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH11P55287 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH11P55287 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH11P55287 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH11P55287 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH11P55287 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH11P55287 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH11P55287 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH11P55287 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH11P55287 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH11P55287 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH11P55287 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH11P55287 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms