Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP12AP54707 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP12AP54707 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP12AP54707 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP12AP54707 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP12AP54707 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP12AP54707 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP12AP54707 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP12AP54707 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP12AP54707 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP12AP54707 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP12AP54707 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP12AP54707 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP12AP54707 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP12AP54707 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP12AP54707 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP12AP54707 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP12AP54707 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP12AP54707 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP12AP54707 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP12AP54707 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP12AP54707 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP12AP54707 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP12AP54707 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP12AP54707 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP12AP54707 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP12AP54707 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP12AP54707 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP12AP54707 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP12AP54707 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP12AP54707 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms