Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24CP53992 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24CP53992 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24CP53992 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24CP53992 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24CP53992 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24CP53992 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24CP53992 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24CP53992 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24CP53992 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24CP53992 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24CP53992 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC24CP53992 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24CP53992 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24CP53992 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24CP53992 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC24CP53992 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24CP53992 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24CP53992 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24CP53992 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24CP53992 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24CP53992 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24CP53992 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24CP53992 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC24CP53992 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC24CP53992 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC24CP53992 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC24CP53992 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SEC24CP53992 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC24CP53992 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC24CP53992 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24CP53992 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24CP53992 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24CP53992 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24CP53992 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24CP53992 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24CP53992 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24CP53992 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24CP53992 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24CP53992 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24CP53992 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24CP53992 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24CP53992 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24CP53992 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24CP53992 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24CP53992 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24CP53992 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24CP53992 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24CP53992 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC24CP53992 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC24CP53992 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC24CP53992 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SEC24CP53992 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SEC24CP53992 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24CP53992 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24CP53992 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24CP53992 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC24CP53992 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24CP53992 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24CP53992 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24CP53992 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24CP53992 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24CP53992 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC24CP53992 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24CP53992 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms