Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMSP52788 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMSP52788 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMSP52788 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMSP52788 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMSP52788 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMSP52788 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMSP52788 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMSP52788 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMSP52788 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMSP52788 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMSP52788 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMSP52788 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMSP52788 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMSP52788 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMSP52788 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMSP52788 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMSP52788 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMSP52788 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMSP52788 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMSP52788 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMSP52788 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMSP52788 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMSP52788 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMSP52788 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMSP52788 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMSP52788 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMSP52788 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMSP52788 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMSP52788 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMSP52788 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMSP52788 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMSP52788 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMSP52788 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMSP52788 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMSP52788 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMSP52788 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMSP52788 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMSP52788 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMSP52788 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMSP52788 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMSP52788 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMSP52788 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMSP52788 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMSP52788 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMSP52788 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMSP52788 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMSP52788 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMSP52788 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMSP52788 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMSP52788 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMSP52788 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMSP52788 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMSP52788 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMSP52788 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMSP52788 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMSP52788 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMSP52788 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMSP52788 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMSP52788 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMSP52788 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMSP52788 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMSP52788 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMSP52788 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMSP52788 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMSP52788 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMSP52788 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMSP52788 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMSP52788 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMSP52788 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMSP52788 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMSP52788 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMSP52788 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMSP52788 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMSP52788 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMSP52788 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMSP52788 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMSP52788 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMSP52788 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMSP52788 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMSP52788 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMSP52788 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMSP52788 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMSP52788 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMSP52788 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMSP52788 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMSP52788 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMSP52788 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMSP52788 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMSP52788 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMSP52788 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMSP52788 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMSP52788 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMSP52788 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMSP52788 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMSP52788 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMSP52788 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMSP52788 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMSP52788 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMSP52788 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms