Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF135P52742 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF135P52742 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF135P52742 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF135P52742 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF135P52742 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF135P52742 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF135P52742 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF135P52742 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF135P52742 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF135P52742 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF135P52742 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF135P52742 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF135P52742 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF135P52742 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF135P52742 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF135P52742 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF135P52742 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF135P52742 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF135P52742 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF135P52742 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF135P52742 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF135P52742 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF135P52742 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF135P52742 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF135P52742 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF135P52742 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF135P52742 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF135P52742 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF135P52742 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF135P52742 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF135P52742 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF135P52742 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF135P52742 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF135P52742 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF135P52742 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF135P52742 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF135P52742 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF135P52742 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF135P52742 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF135P52742 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF135P52742 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF135P52742 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF135P52742 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF135P52742 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF135P52742 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF135P52742 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF135P52742 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF135P52742 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF135P52742 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF135P52742 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF135P52742 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF135P52742 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF135P52742 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF135P52742 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF135P52742 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF135P52742 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF135P52742 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF135P52742 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF135P52742 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF135P52742 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF135P52742 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF135P52742 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF135P52742 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms