Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR4P51679 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR4P51679 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR4P51679 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCR4P51679 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR4P51679 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR4P51679 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR4P51679 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR4P51679 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR4P51679 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR4P51679 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR4P51679 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR4P51679 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR4P51679 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR4P51679 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR4P51679 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR4P51679 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR4P51679 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR4P51679 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR4P51679 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCR4P51679 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCR4P51679 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR4P51679 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR4P51679 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR4P51679 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR4P51679 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR4P51679 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR4P51679 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR4P51679 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR4P51679 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR4P51679 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR4P51679 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR4P51679 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR4P51679 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR4P51679 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCR4P51679 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCR4P51679 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR4P51679 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR4P51679 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR4P51679 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR4P51679 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR4P51679 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR4P51679 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR4P51679 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR4P51679 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR4P51679 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR4P51679 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR4P51679 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR4P51679 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR4P51679 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR4P51679 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR4P51679 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR4P51679 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR4P51679 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR4P51679 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR4P51679 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR4P51679 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR4P51679 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR4P51679 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR4P51679 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR4P51679 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR4P51679 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR4P51679 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR4P51679 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR4P51679 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR4P51679 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR4P51679 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR4P51679 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR4P51679 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR4P51679 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR4P51679 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR4P51679 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR4P51679 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR4P51679 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR4P51679 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR4P51679 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR4P51679 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR4P51679 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR4P51679 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR4P51679 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR4P51679 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR4P51679 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR4P51679 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR4P51679 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR4P51679 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR4P51679 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCR4P51679 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCR4P51679 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR4P51679 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR4P51679 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR4P51679 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR4P51679 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR4P51679 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR4P51679 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR4P51679 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR4P51679 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR4P51679 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR4P51679 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR4P51679 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR4P51679 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms