Protein–RNA interactions for Protein: P51153

RAB13, Ras-related protein Rab-13, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB13P51153 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB13P51153 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB13P51153 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB13P51153 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB13P51153 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB13P51153 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB13P51153 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB13P51153 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB13P51153 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB13P51153 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB13P51153 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB13P51153 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB13P51153 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB13P51153 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB13P51153 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB13P51153 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB13P51153 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB13P51153 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB13P51153 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB13P51153 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB13P51153 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB13P51153 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB13P51153 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB13P51153 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB13P51153 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB13P51153 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB13P51153 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB13P51153 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB13P51153 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB13P51153 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB13P51153 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB13P51153 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB13P51153 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB13P51153 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB13P51153 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB13P51153 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB13P51153 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB13P51153 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB13P51153 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB13P51153 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB13P51153 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB13P51153 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB13P51153 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB13P51153 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB13P51153 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB13P51153 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB13P51153 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB13P51153 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB13P51153 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB13P51153 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB13P51153 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB13P51153 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB13P51153 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB13P51153 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB13P51153 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB13P51153 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB13P51153 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB13P51153 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB13P51153 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB13P51153 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB13P51153 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB13P51153 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB13P51153 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB13P51153 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB13P51153 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB13P51153 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB13P51153 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB13P51153 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB13P51153 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB13P51153 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB13P51153 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB13P51153 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB13P51153 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB13P51153 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB13P51153 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB13P51153 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB13P51153 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB13P51153 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB13P51153 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB13P51153 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB13P51153 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB13P51153 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB13P51153 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB13P51153 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB13P51153 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB13P51153 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB13P51153 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB13P51153 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB13P51153 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB13P51153 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB13P51153 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB13P51153 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB13P51153 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB13P51153 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB13P51153 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB13P51153 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB13P51153 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB13P51153 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB13P51153 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB13P51153 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms