Protein–RNA interactions for Protein: P50851

LRBA, Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRBAP50851 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRBAP50851 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRBAP50851 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRBAP50851 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRBAP50851 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRBAP50851 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRBAP50851 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRBAP50851 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRBAP50851 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRBAP50851 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRBAP50851 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRBAP50851 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRBAP50851 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRBAP50851 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRBAP50851 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRBAP50851 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRBAP50851 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRBAP50851 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRBAP50851 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRBAP50851 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRBAP50851 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRBAP50851 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRBAP50851 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRBAP50851 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRBAP50851 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRBAP50851 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRBAP50851 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRBAP50851 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRBAP50851 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRBAP50851 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRBAP50851 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRBAP50851 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRBAP50851 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRBAP50851 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRBAP50851 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRBAP50851 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRBAP50851 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRBAP50851 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRBAP50851 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRBAP50851 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRBAP50851 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRBAP50851 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRBAP50851 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRBAP50851 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRBAP50851 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRBAP50851 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRBAP50851 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRBAP50851 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRBAP50851 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRBAP50851 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRBAP50851 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRBAP50851 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRBAP50851 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRBAP50851 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRBAP50851 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRBAP50851 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRBAP50851 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRBAP50851 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRBAP50851 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRBAP50851 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRBAP50851 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRBAP50851 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRBAP50851 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRBAP50851 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRBAP50851 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRBAP50851 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRBAP50851 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRBAP50851 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRBAP50851 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRBAP50851 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRBAP50851 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRBAP50851 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRBAP50851 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRBAP50851 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LRBAP50851 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRBAP50851 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRBAP50851 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRBAP50851 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRBAP50851 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRBAP50851 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRBAP50851 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRBAP50851 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRBAP50851 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRBAP50851 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRBAP50851 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRBAP50851 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRBAP50851 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRBAP50851 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRBAP50851 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRBAP50851 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRBAP50851 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRBAP50851 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRBAP50851 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRBAP50851 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRBAP50851 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRBAP50851 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRBAP50851 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRBAP50851 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRBAP50851 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRBAP50851 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms