Protein–RNA interactions for Protein: P49908

SELENOP, Selenoprotein P, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOPP49908 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SELENOPP49908 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SELENOPP49908 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SELENOPP49908 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SELENOPP49908 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SELENOPP49908 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SELENOPP49908 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SELENOPP49908 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SELENOPP49908 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SELENOPP49908 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SELENOPP49908 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SELENOPP49908 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SELENOPP49908 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SELENOPP49908 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SELENOPP49908 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SELENOPP49908 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms