Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms