Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIA4P48058 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIA4P48058 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIA4P48058 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIA4P48058 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIA4P48058 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIA4P48058 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIA4P48058 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIA4P48058 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIA4P48058 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIA4P48058 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIA4P48058 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIA4P48058 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIA4P48058 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIA4P48058 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIA4P48058 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIA4P48058 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIA4P48058 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIA4P48058 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIA4P48058 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIA4P48058 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIA4P48058 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIA4P48058 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIA4P48058 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIA4P48058 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms