Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSN1S1P47710 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSN1S1P47710 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSN1S1P47710 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSN1S1P47710 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSN1S1P47710 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSN1S1P47710 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSN1S1P47710 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSN1S1P47710 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSN1S1P47710 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSN1S1P47710 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSN1S1P47710 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSN1S1P47710 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSN1S1P47710 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSN1S1P47710 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSN1S1P47710 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSN1S1P47710 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms