Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
NEDD4P46934 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEDD4P46934 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEDD4P46934 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEDD4P46934 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEDD4P46934 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEDD4P46934 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NEDD4P46934 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NEDD4P46934 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEDD4P46934 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEDD4P46934 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEDD4P46934 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEDD4P46934 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NEDD4P46934 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEDD4P46934 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEDD4P46934 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NEDD4P46934 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NEDD4P46934 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEDD4P46934 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEDD4P46934 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NEDD4P46934 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEDD4P46934 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEDD4P46934 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEDD4P46934 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NEDD4P46934 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NEDD4P46934 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NEDD4P46934 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms