Protein–RNA interactions for Protein: P46098

HTR3A, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3AP46098 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR3AP46098 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTR3AP46098 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTR3AP46098 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTR3AP46098 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTR3AP46098 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR3AP46098 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTR3AP46098 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTR3AP46098 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTR3AP46098 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR3AP46098 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR3AP46098 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR3AP46098 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR3AP46098 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR3AP46098 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HTR3AP46098 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HTR3AP46098 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTR3AP46098 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTR3AP46098 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR3AP46098 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR3AP46098 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR3AP46098 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR3AP46098 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR3AP46098 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR3AP46098 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR3AP46098 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR3AP46098 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR3AP46098 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR3AP46098 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR3AP46098 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR3AP46098 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR3AP46098 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR3AP46098 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR3AP46098 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR3AP46098 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR3AP46098 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR3AP46098 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR3AP46098 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR3AP46098 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR3AP46098 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR3AP46098 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms