Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSFMP43897 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TSFMP43897 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSFMP43897 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSFMP43897 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSFMP43897 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSFMP43897 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSFMP43897 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSFMP43897 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSFMP43897 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSFMP43897 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSFMP43897 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSFMP43897 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSFMP43897 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSFMP43897 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSFMP43897 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSFMP43897 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSFMP43897 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSFMP43897 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSFMP43897 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSFMP43897 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSFMP43897 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSFMP43897 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSFMP43897 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSFMP43897 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSFMP43897 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSFMP43897 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSFMP43897 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSFMP43897 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSFMP43897 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSFMP43897 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSFMP43897 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TSFMP43897 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSFMP43897 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSFMP43897 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSFMP43897 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSFMP43897 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSFMP43897 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSFMP43897 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSFMP43897 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSFMP43897 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSFMP43897 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSFMP43897 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSFMP43897 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSFMP43897 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSFMP43897 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSFMP43897 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSFMP43897 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSFMP43897 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSFMP43897 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSFMP43897 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSFMP43897 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSFMP43897 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSFMP43897 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSFMP43897 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSFMP43897 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSFMP43897 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSFMP43897 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSFMP43897 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TSFMP43897 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSFMP43897 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSFMP43897 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSFMP43897 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSFMP43897 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSFMP43897 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TSFMP43897 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSFMP43897 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSFMP43897 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TSFMP43897 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSFMP43897 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSFMP43897 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSFMP43897 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSFMP43897 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSFMP43897 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSFMP43897 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TSFMP43897 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSFMP43897 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSFMP43897 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSFMP43897 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSFMP43897 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSFMP43897 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TSFMP43897 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSFMP43897 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TSFMP43897 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSFMP43897 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSFMP43897 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSFMP43897 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSFMP43897 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSFMP43897 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSFMP43897 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSFMP43897 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSFMP43897 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSFMP43897 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSFMP43897 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSFMP43897 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSFMP43897 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSFMP43897 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSFMP43897 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSFMP43897 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSFMP43897 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms