Protein–RNA interactions for Protein: P43362

MAGEA9, Melanoma-associated antigen 9, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA9P43362 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MAGEA9P43362 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAGEA9P43362 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MAGEA9P43362 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAGEA9P43362 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAGEA9P43362 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAGEA9P43362 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAGEA9P43362 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAGEA9P43362 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAGEA9P43362 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAGEA9P43362 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAGEA9P43362 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAGEA9P43362 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAGEA9P43362 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAGEA9P43362 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAGEA9P43362 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAGEA9P43362 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAGEA9P43362 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAGEA9P43362 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAGEA9P43362 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAGEA9P43362 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAGEA9P43362 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MAGEA9P43362 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAGEA9P43362 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MAGEA9P43362 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAGEA9P43362 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAGEA9P43362 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAGEA9P43362 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAGEA9P43362 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MAGEA9P43362 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAGEA9P43362 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAGEA9P43362 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAGEA9P43362 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAGEA9P43362 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAGEA9P43362 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAGEA9P43362 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAGEA9P43362 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAGEA9P43362 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAGEA9P43362 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAGEA9P43362 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAGEA9P43362 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAGEA9P43362 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAGEA9P43362 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAGEA9P43362 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAGEA9P43362 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAGEA9P43362 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAGEA9P43362 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAGEA9P43362 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAGEA9P43362 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAGEA9P43362 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAGEA9P43362 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAGEA9P43362 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAGEA9P43362 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAGEA9P43362 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAGEA9P43362 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAGEA9P43362 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAGEA9P43362 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAGEA9P43362 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAGEA9P43362 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAGEA9P43362 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAGEA9P43362 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAGEA9P43362 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MAGEA9P43362 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAGEA9P43362 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAGEA9P43362 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAGEA9P43362 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MAGEA9P43362 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAGEA9P43362 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms