Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGFBR1P36897 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGFBR1P36897 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGFBR1P36897 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGFBR1P36897 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGFBR1P36897 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGFBR1P36897 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TGFBR1P36897 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGFBR1P36897 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TGFBR1P36897 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGFBR1P36897 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGFBR1P36897 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGFBR1P36897 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGFBR1P36897 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGFBR1P36897 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGFBR1P36897 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGFBR1P36897 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGFBR1P36897 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGFBR1P36897 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TGFBR1P36897 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGFBR1P36897 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGFBR1P36897 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGFBR1P36897 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGFBR1P36897 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGFBR1P36897 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGFBR1P36897 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGFBR1P36897 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGFBR1P36897 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGFBR1P36897 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TGFBR1P36897 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGFBR1P36897 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGFBR1P36897 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGFBR1P36897 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR1P36897 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGFBR1P36897 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGFBR1P36897 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGFBR1P36897 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGFBR1P36897 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGFBR1P36897 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGFBR1P36897 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGFBR1P36897 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGFBR1P36897 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGFBR1P36897 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGFBR1P36897 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGFBR1P36897 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGFBR1P36897 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGFBR1P36897 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGFBR1P36897 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGFBR1P36897 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms