Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX6P35712 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX6P35712 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX6P35712 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX6P35712 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX6P35712 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SOX6P35712 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX6P35712 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX6P35712 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX6P35712 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX6P35712 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX6P35712 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX6P35712 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX6P35712 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX6P35712 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX6P35712 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX6P35712 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX6P35712 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX6P35712 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX6P35712 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX6P35712 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX6P35712 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX6P35712 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX6P35712 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX6P35712 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX6P35712 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX6P35712 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX6P35712 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX6P35712 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX6P35712 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX6P35712 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX6P35712 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX6P35712 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX6P35712 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX6P35712 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX6P35712 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX6P35712 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX6P35712 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX6P35712 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX6P35712 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX6P35712 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX6P35712 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX6P35712 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX6P35712 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX6P35712 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX6P35712 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX6P35712 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX6P35712 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX6P35712 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX6P35712 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX6P35712 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX6P35712 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX6P35712 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX6P35712 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX6P35712 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX6P35712 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX6P35712 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX6P35712 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX6P35712 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX6P35712 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX6P35712 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX6P35712 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX6P35712 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX6P35712 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX6P35712 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX6P35712 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX6P35712 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX6P35712 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX6P35712 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX6P35712 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX6P35712 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SOX6P35712 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SOX6P35712 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX6P35712 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX6P35712 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX6P35712 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX6P35712 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX6P35712 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX6P35712 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX6P35712 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX6P35712 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX6P35712 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX6P35712 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX6P35712 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX6P35712 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX6P35712 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX6P35712 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX6P35712 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX6P35712 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX6P35712 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX6P35712 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX6P35712 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX6P35712 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX6P35712 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX6P35712 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX6P35712 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX6P35712 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX6P35712 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX6P35712 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX6P35712 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms