Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP1P32455 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP1P32455 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP1P32455 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP1P32455 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP1P32455 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP1P32455 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP1P32455 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GBP1P32455 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBP1P32455 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GBP1P32455 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GBP1P32455 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GBP1P32455 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GBP1P32455 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GBP1P32455 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GBP1P32455 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GBP1P32455 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GBP1P32455 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GBP1P32455 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GBP1P32455 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GBP1P32455 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GBP1P32455 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GBP1P32455 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GBP1P32455 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GBP1P32455 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GBP1P32455 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GBP1P32455 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GBP1P32455 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GBP1P32455 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GBP1P32455 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GBP1P32455 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP1P32455 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP1P32455 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GBP1P32455 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GBP1P32455 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GBP1P32455 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GBP1P32455 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GBP1P32455 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GBP1P32455 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GBP1P32455 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GBP1P32455 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GBP1P32455 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GBP1P32455 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GBP1P32455 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP1P32455 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP1P32455 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP1P32455 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP1P32455 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP1P32455 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP1P32455 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP1P32455 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GBP1P32455 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GBP1P32455 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP1P32455 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GBP1P32455 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GBP1P32455 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GBP1P32455 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GBP1P32455 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GBP1P32455 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GBP1P32455 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GBP1P32455 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GBP1P32455 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP1P32455 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP1P32455 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBP1P32455 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GBP1P32455 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GBP1P32455 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GBP1P32455 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GBP1P32455 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GBP1P32455 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBP1P32455 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBP1P32455 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GBP1P32455 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GBP1P32455 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GBP1P32455 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GBP1P32455 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GBP1P32455 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GBP1P32455 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GBP1P32455 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GBP1P32455 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GBP1P32455 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GBP1P32455 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GBP1P32455 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GBP1P32455 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GBP1P32455 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP1P32455 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP1P32455 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP1P32455 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP1P32455 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP1P32455 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP1P32455 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP1P32455 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP1P32455 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP1P32455 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP1P32455 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP1P32455 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP1P32455 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP1P32455 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GBP1P32455 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GBP1P32455 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms