Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFRSF8P28908 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFRSF8P28908 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFRSF8P28908 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFRSF8P28908 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFRSF8P28908 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFRSF8P28908 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNFRSF8P28908 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNFRSF8P28908 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFRSF8P28908 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFRSF8P28908 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFRSF8P28908 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFRSF8P28908 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFRSF8P28908 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFRSF8P28908 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFRSF8P28908 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFRSF8P28908 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFRSF8P28908 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFRSF8P28908 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFRSF8P28908 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFRSF8P28908 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFRSF8P28908 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNFRSF8P28908 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFRSF8P28908 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFRSF8P28908 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFRSF8P28908 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFRSF8P28908 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF8P28908 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF8P28908 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF8P28908 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF8P28908 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF8P28908 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF8P28908 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF8P28908 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF8P28908 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF8P28908 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF8P28908 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF8P28908 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF8P28908 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF8P28908 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF8P28908 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFRSF8P28908 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TNFRSF8P28908 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFRSF8P28908 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFRSF8P28908 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFRSF8P28908 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFRSF8P28908 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFRSF8P28908 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFRSF8P28908 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFRSF8P28908 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFRSF8P28908 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFRSF8P28908 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFRSF8P28908 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFRSF8P28908 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFRSF8P28908 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNFRSF8P28908 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNFRSF8P28908 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFRSF8P28908 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFRSF8P28908 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFRSF8P28908 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFRSF8P28908 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFRSF8P28908 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFRSF8P28908 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFRSF8P28908 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFRSF8P28908 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFRSF8P28908 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFRSF8P28908 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFRSF8P28908 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNFRSF8P28908 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFRSF8P28908 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms