Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCNE1P24864 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCNE1P24864 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCNE1P24864 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCNE1P24864 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCNE1P24864 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCNE1P24864 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCNE1P24864 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCNE1P24864 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCNE1P24864 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCNE1P24864 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCNE1P24864 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCNE1P24864 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCNE1P24864 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCNE1P24864 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCNE1P24864 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CCNE1P24864 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCNE1P24864 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCNE1P24864 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCNE1P24864 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCNE1P24864 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCNE1P24864 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCNE1P24864 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCNE1P24864 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCNE1P24864 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCNE1P24864 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCNE1P24864 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCNE1P24864 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCNE1P24864 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCNE1P24864 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCNE1P24864 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCNE1P24864 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCNE1P24864 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCNE1P24864 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCNE1P24864 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCNE1P24864 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCNE1P24864 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCNE1P24864 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCNE1P24864 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNE1P24864 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCNE1P24864 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCNE1P24864 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCNE1P24864 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCNE1P24864 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCNE1P24864 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms